酶在飼料中的主要作用是提高飼料中消化養分的比例，提高飼料的利用率。

動物飼料主要分為谷物類及粕類，植物細胞壁的存在影響了養分的消化吸收。豬、禽等自然分泌的酶無法分解細胞壁，所以只有在飼料中補加相應的酶才能將其降解。玉米、大麥等谷類以及麥麩、餅粕等農副產品，經添加纖維素酶類、半纖維素酶和果膠酶，在幾組酶的協同作用下才能破壞植物的細胞壁，使其變得松軟，促使細胞壁及其細胞內容物在動物胃腸中消化吸收，從而提高飼料利用率。

我國是一個農業大國，農作物秸稈資源十分豐富，作物秸稈中約有65%~80%的干物質能夠向動物提供能量，而目前用作飼料的不足10%，絕大部分農作物秸稈仍直接還田或作為燃料使用，既造成資源浪費，又污染環境。

除了牛等少數草食家畜能消化秸稈中的纖維素之外，其他家畜都不能利用這部分能量，而且由于纖維素的存在，反而會影響其他營養物質的消化，從而降低飼料營養價值。纖維素酶是分解纖維素的一類酶的總稱，其主要作用是降解畜禽消化道內NSP，降低腸道內容物黏性，促進營養物質吸收，減少禽畜下痢，從而促進畜禽生長和提高飼料利用率。農物秸稈中含有較多的NSP，主要包括阿拉伯木聚糖、葡聚糖、半乳糖、果膠、纖維素等。因單胃動物不能分解NSP，從而使其成為一種抗營養因子。酶制劑可消除飼糧中的抗營養因子，提高飼料利用率，節約飼料資源。